Научно-исследовательский институт почвоведения и агрохимии был создан в 1920 году как Институт почвоведения и геоботаники Туркестанского государственного университета. В 1932 году он был реорганизован в Центральную станцию удобрений и агропочвоведов Всесоюзного научно-исследовательского института хлопка, а в 1943 году преобразован в Институт почвоведения Академии наук Узбекистана. В 1972 году был создан Институт агрохимии под названием Институт почвоведения и агрохимии. С 1998 по 2014 год институт входил в состав Государственного комитета геодезии и кадастра Республики Узбекистан, с 2014 по 2017 год входил в Узбекский сельскохозяйственный научно-производственный центр, с 2017 по 2020 год входил в состав Узбекского сельскохозяйственного научно-производственного центра. Государственный комитет земельных ресурсов, геодезии, картографии и государственного кадастра. Указ Президента Республики Узбекистан от 7 сентября 2020 года № ПФ-6061 «О мерах по коренному совершенствованию системы учета земель и государственного кадастра» и Указ Президента Республики Узбекистан от 7 сентября 2020 года » О мерах по организации Кадастрового агентства при Государственном налоговом комитете «Национальный центр сельскохозяйственных знаний и инноваций при Министерстве сельского хозяйства действует на основании Постановления № PQ-4819« О мерах ».